その違いは、作用する数値が異なる点です。

以下の例でご説明させていただきます。
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基礎率兵数：100
スキルA：基礎率兵数+5%
スキルB：率兵数+（基礎数値の）10%
※武将の統率能力値による率兵数上昇を考慮しない

スキルAのみが発生する場合：
率兵数=100*5%+100＝105

スキルBのみが発生する場合：
率兵数=100*10%+100=110

スキルAとBが同時に発生する場合：
率兵数=（100*5%+100）*10%+（100*5%+100）=115
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